Statutárním orgánem ČAZV je ředitel, kterého jmenuje a odvolává zřizovatel. Ředitel je přímo podřízen a odpovědný zřizovateli.
Ředitelkou ČAZV byla jmenována Ing. Hana Urbancová, Ph.D., DBA
„Naše kroky budou směřovat k tomu, aby ČAZV byla nadále kvalitním partnerem Ministerstva zemědělství a zároveň dynamicky se rozvíjející moderní organizací. Chceme se zaměřit na rozvoj organizace, především k povědomí odborné i laické veřejnosti. Budeme podporovat participaci ČAZV na mezinárodních konferencích, propagovat organizaci a zemědělský výzkum v rámci tištěných periodik a podporovat roli poradenství ČAZV v rámci všech specializovaných odborů ČAZV.“
Dle Statutu a Jednacího řádu České akademie zemědělských věd ředitel zejména:
- předkládá zřizovateli návrh rozpočtu a kvalifikační struktury zaměstnanců;
- přímo řídí činnost zaměstnanců zajišťujících v souladu s právními předpisy pracovně-právní a personální agendu, společné ekonomické, technické a administrativní záležitosti, bezpečnost a ochranu zdraví při práci a oblast krizového řízení;
- vykonává správu rozpočtu a zajišťuje jeho plnění;
- uzavírá všechny dokumenty, jejichž stranou je ČAZV;
- vydává a schvaluje všechny vnitřní předpisy (týkající se chodu organizace i řízení lidských zdrojů)
- zajištuje PR (public relations) ČAZV;
- zabezpečuje úkoly vyplývající z uzavřených dohod mezi ČAZV a MZe;
- odpovídá za udržování a rozvíjení zahraničních styků ČAZV na základě uzavřených dohod a ujednání předsednictva v souladu se zřizovací listinou;
- je členem Vydavatelské rady;
- a další dle Statutu a Jednacího řádu ČAZV.
Ředitel řídí a koordinuje činnost oddělení sekretariátu a oddělení redakce.